本作是1985年上映的“大雄的宇宙小战争”之重制版，为哆啦A梦电影的第41部。在暑假的某日，大雄捡到一艘火箭外形的迷你宇宙飞船，飞船中藏着巴掌大小的外星人帕比，原来帕比是匹里卡星的大总统，但反抗军在匹里卡星发起了政变。借助哆啦A梦的道具“缩小灯”，大雄一伙可以缩小得如同人偶，和外星人一起玩乐。然而，来自帕比家乡的鲸鱼型战舰袭击了哆啦A梦与大雄。为了守护朋友和他的家乡，哆啦A梦与他的朋友决定前往帕比的家乡匹里卡星，携手对抗反抗军。