宇宙世纪0088年，经过格利普斯战役，提坦兹（Titans）被消灭，奥古（AEUG）的实力也大大削弱。吉恩军残余部队在摄政王哈曼・坎恩的率领下趁机以“新吉恩”的名义称霸地球。在格利普斯战役中受损的奥古军宇宙战舰“阿伽马号”临时停靠在Side1的殖民卫星“香格里拉”。此地经营废品回收业务的捷度・阿西塔和朋友们盯上了阿伽马内的Z高达，准备偷出来卖钱。恰好此时与阿伽马敌对的新吉恩军巡洋舰“安多拉号”也来到了香格里拉，捷度等人被卷入了战斗。